【項目內容】
文獻數據是醫學知識的顯性載體，互聯網上日益豐富的文獻是不可多得的優質資源與科研寶藏。從海量醫學文獻數據和信息中精準抽取醫學知識不僅是保持知識更新、提高研究效率的有效路徑，更是孕育大量醫學科研創新成果的“藍海”。
本課程聚焦醫學文獻大數據中的知識挖掘，基于常見疾病場景及經典案例進行課程設計，強調數據分析賦能科研產出，突出創新性與實用性，旨在培訓學員：
【辦學單位】
北京大學醫學繼續教育學院
【學術支持單位】
北京大學健康醫療大數據國家研究院
【招生對象】
本次工作坊的教學案例主要根據常見疾病場景設計，適合希望通過學習，全面提升應用公開數據資源開展醫學研究能力的臨床工作者，及健康數據科學相關從業者等。包括但不限于：
有需要沒思路，面對海量文獻數據無從下手的研究新人；
有想法缺證據，希望通過文獻數據挖掘醫學知識、支撐課題設計和臨床決策的科研骨干；
有基礎待提升，希望基于海量文獻數據分析，產出高質量創新科研成果的臨床科研人員；
對醫學文獻資源感興趣，希望通過文獻分析快速精準定位業內關鍵成果，高效追蹤行業進展和熱點的專業人員。
【培訓地點】
線上直播授課（騰訊會議網絡平臺授課）。
【培訓時間】
2023年10月25日-11月5日。
平日晚18:30-21:00，周末上午8:30-12:00，下午13:30-18:00，共計30學時。
見具體課程安排。
【課程安排】
時間 |
主題 |
案例分析/操作練習 |
10月25日（周三）
18:30-21:00 |
18:30-19:00 專家講座：張路霞 北京大學 |
醫學知識圖譜應用——數據科學家（知識發現）與實驗科學家（科學發現）的互動 |
從臨床醫師到醫師科學家-大數據時代的新契機 |
19:00-21:00發揮文獻價值：海量文獻自動處理與知識挖掘 |
l 鏈接思維：以PubMed為中心的數據庫之間知識鏈接 |
l 快速上手：知識挖掘簡易工具 |
10月27日（周五）
18:30-21:00 |
18:30-20:00善用公開資源：高質量公開知識庫的探知與復用 |
慢性病治療方案的大規模跨國研究 |
l 賦能醫療大數據分析的公共知識庫 |
l 不同體系之間的術語映射及其標準化 |
l 醫學知識體系應用進展 |
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20:00-21:00 專家講座：袁馳 河海大學計算機學院
臨床試驗納排標準中的知識抽取與二次利用 |
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10月29日（周日）
8:30-12:00 |
8:30-9:30 專家講座：Bei Yu 美國雪城大學
科學出版物與新聞中因果關系主張、健康建議及夸張表述的自然語言理解 |
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9:30-12:30梳理研究綜述：如何快速鎖定流行病學數據與關鍵文獻？ |
疾病負擔分布與醫學文獻關聯分析——以腦卒中研究為例 |
l 疾病負擔數據獲取 |
l 關鍵文獻識別 |
l 科學主張可靠性評估 |
10月29日（周日）
13:30-18:00 |
13:30-17:00優化研究設計：如何結合醫學文獻與知識圖譜進行因果特征選擇？ |
混雜、中介、對撞變量及背后證據的發現——以抑郁作為阿爾茲海默癥的危險因素 |
l 知識圖譜及三元組數據：結構化數據的檢索與獲取 |
l 圖數據庫Neo4j的構建及查詢 |
l 使用大語言模型進行因果關系抽取 |
17:00-18:00 專家講座：劉婷 荷蘭阿姆斯特丹大學
利用知識圖譜技術探索腸道微生物與精神疾病的關系 |
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11月1日（周三）
18:30-21:00 |
18:30-20:00 專家講座：步一 北京大學
復雜網絡分析基礎及其醫學應用 |
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20:00-21:00 啟發研究假設：如何使用開源工具構建及分析復雜疾病的病因網絡？ |
利用病因網絡分析方法發現潛在影響因素——以糖尿病腎病為例 |
l 病因網絡構建演示與實操 |
11月3日（周五）
18:30-21:00 |
18:30-20:00 跟蹤研究趨勢：如何基于文獻數據揭示特定疾病領域的研究結構？ |
研究領域內重要主題解讀和發展脈絡繪制——以心腦血管疾病為例 |
l 元數據分析（作者、機構、國家、期刊等） |
l MeSH主題詞挖掘（科學基金、臨床試驗與學術文獻） |
l 主題聚類分析與工具（VOSviewer, Gephi） |
20:00-21:00 專家講座：吳夢佳 悉尼科技大學
基于異質圖神經網絡的基因-疾病關系分類和預測 |
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11月4日（周六）
8:30-12:00 |
綜合研究證據：如何通過系統綜述和meta分析匯總分析現有文獻證據？ |
從不同試驗結果中計算出綜合效應——以新型糖尿病藥物為例 |
l 系統綜述及meta分析：作用及證據等級 |
l 使用文獻數據庫進行系統綜述 |
l Meta分析方法 |
11月5日（周日）
8:30-12:30 |
線下學員答疑（問題展示、教師答疑、集體討論、互相啟發） 線上同步直播互動
12：00-12：30 課程回顧與總結 |
【主講教師】
杜 建 北京大學健康醫療大數據國家研究院 助理教授等
【培訓證書】
學員完成全部課程學習，考評合格，將頒發北京大學結業證書，加蓋北京大學鋼印。
【報名繳費】
1. 費用：5400 元/人
注：學員完成全部課程學習，考評合格，將頒發北京大學結業證書，加蓋北京大學鋼印。
2. 報名繳費流程：
1）報名：掃描下方二維碼填寫報名信息。
2）繳費：將培訓費用于截止日期前全額匯入以下賬戶：
賬戶名稱：北京大學醫學部
開戶銀行：工商銀行北京東升路支行
賬 號：0200 0062 0901 4460 440
用途（匯款時請備注）：健康數據科研+學員姓名
3）確認：將繳費憑證（轉賬截圖/匯款憑證照片）通過微信或郵件發送給報名聯系人崔老師（聯系方式見下），確認報名成功。
3. 報名繳費截止時間：2023年10月20日。
注：小班授課，人數有限，額滿即止（以繳費順序為準）。
