北京大學健康醫療大數據平臺簡介
北京大學健康醫療大數據平臺集成多源健康醫療大數據、采用國際前沿的數據處理和分析技術,為國家健康醫療戰略、醫學實踐和全人群健康管理提供大數據驅動的決策支持服務。
平臺集中部署運行在北京大學健康醫療大數據國家研究院自建機房,可實現健康醫療大數據標準化、流程化、自動化、系統化的專業安全運維管理。
2019年4月\2020年12月,北京大學健康醫療大數據平臺兩次通過了中國信息安全測評中心的國家信息系統安全等級保護三級測評(業務信息安全等級為第三級、系統服務安全等級為第三級、網絡安全保護等級為第三級【S3A3】
依照2019年5月國務院頒布《中華人民共和國人類遺傳資源管理條例》,北京大學健康醫療大數據國家研究院按政策引導建設了北京大學健康醫療大數據分析保藏平臺,建設方案經我校倫理委員會審批后遞交科技部中國人類遺傳資源管理辦公室申請保藏行政許可。2020年8月5日上午,由中國人類遺傳資源管理辦公室組織的專家團對我院保藏平臺進行了現場勘查評審。2020年8月25日,獲得中國人類遺傳資源管理辦公室行政審批許可。
公示鏈接:https://fuwu.most.gov.cn/html/rlycjgcx/20200826/123123436.html
北京大學健康醫療大數據平臺由大數據分析模塊和高性能計算模塊組成。大數據分析模塊支持多源異構數據存取及智能多維度建模分析,可實現多源異構的數據查詢、數據模型建設、數據挖掘等功能,滿足不同業務的數據分析需求(數據源探查、面向醫生的科研查詢、統計分析、關聯分析、聚類分析、分類分析等),并且支持多元化統計分析軟件的集成。同時大數據分析模塊處理后的數據可流轉到高性能計算模塊,通過CPU和GPU服務器的高效并行計算能力進行分析,計算后的結果可通過大數據分析模塊中的數據展示功能進行多種可視化形式多維度展示分析成果。
北京大學健康醫療大數據平臺由10Gb與40Gb高速以太網互聯連接,其中大數據分析模塊各節點存儲均由固態硬盤組成,存儲可用容量為210TB、一共有2304GB DDR4內存。高性能計算模塊共有660個處理器核心、4480GB DDR4內存、34塊GPU卡,存儲可用容量1.28PB,讀寫性能9GB/s,總計算能力達到2776.25TFLOPS。
北京大學健康醫療大數據平臺依托北京大學健康醫療大數據國家研究院優勢,在通過信息系統安全等級保護三級的安全保障下,開展了如下項目:
醫學影像分析:利用高性能計算模塊中CPU和GPU服務器的高效并行計算能力,針對于醫學影像數據,采用深度學習和圖像處理技術對公開或者非公開的生物醫學影像數據集與自然圖集進行圖像分割、圖像分類、目標識別等分析,從而形成智能化、自動化模型,用以達到輔助診斷、輔助臨床決策等目的。
組學大數據分析:針對于多組學數據,采用了深度學習和機器學習等技術鑒別疾病組與正常組的差異,聯系臨床癥狀,探究疾病發生發展的(表觀)遺傳因素,為疾病的早診和治療提供理論依據。
NCIS數據分析:NCIS醫療質量控制數據收集系統,在2016年—2019年四年內,持續有近一萬家醫院在系統上填報本醫療機構的醫療質量控制數據。2018年和2019年還搜集了近四千家醫院的病案首頁數據。這些數據,為衛健委編寫的2015年度、2016年度、2017年度、2018年度《國家醫療服務與質量安全報告》提供了客觀、科學的數據參考;也為各醫療機構充分展現了本醫療機構的醫療服務狀況及醫療質量水平,共同為科學評價行業醫療質量水平提供了充足的數據基礎。
北京大學健康醫療大數據平臺可提供的服務:
1、 高性能計算服務
利用高性能計算模塊中CPU和GPU服務器的高效并行計算能力及大容量磁盤陣列數據存儲的支撐,采用了大數據、深度學習、機器學習的分析技術,可以更好的對醫療影像或多組學等數據集的存儲、分析、處理。
2、 大數據分析服務
利用大數據集群服務器的高速計算讀寫能力,支持對多源異構數據存取及智能多維度建模分析,可實現多源異構的數據查詢、數據模型建設、數據挖掘等功能,滿足不同業務的數據分析需求。
3、 服務器托管運維/安全保障服務
4、 虛擬服務器租用服務
(注:詳情請參見附錄北京大學健康醫療大數據國家研究院計算中心資源收費標準)
北京大學健康醫療大數據平臺將竭誠為醫學領域的高性能計算用戶提供高質量的高性能計算服務、以及安全穩定的數據中心機房托管環境,歡迎大家使用!
附錄1
北京大學健康醫療大數據國家研究院
計算中心資源收費標準
北京大學健康醫療大數據國家研究院依據《計算中心資源使用管理制度》,參考IDC機房服務的市場價格,收費標準如下:
項目 |
規格 |
使用費用(元/月) |
備注 |
占地費 |
1U |
800 |
|
2U |
1200 |
||
4U |
1600 |
||
帶寬 費用 |
帶寬 |
使用費用(元/月) |
備注 |
10Mbps |
3800 |
||
50Mbps |
9000 |
||
100Mbps |
12000 |
||
計算公式 |
托管費=占地費+帶寬 例:1U服務器+10Mbps帶寬=800+3800=4600元/月;托管服務器都需要獨立申請帶寬,不與計算中心自有服務器共享 |
校內用戶:
項目 |
規格 |
使用費用 |
是否選用 |
虛擬服務器租用 |
1個虛擬CPU 1G內存, 30G硬盤空間(SAS硬盤) |
125元/月 |
CPU(個): 內存(G): 硬盤(G): |
1個虛擬CPU 1G內存, 30G硬盤空間(SSD硬盤) |
250元/月 |
CPU(個): 內存(G): 硬盤(G): |
|
備注 |
-每增加1個CPU費用為50元/月 -每增加1G內存費用為20元/月 -每增加10G磁盤(SAS硬盤)空間費用為10元/月,每增加10G磁盤(SSD硬盤)空間費用為20元/月 *最小租用單位為月 *默認共享100M帶寬,申請獨立帶寬需額外收費 |
校外用戶:
項目 |
規格 |
使用費用 |
是否選用 |
虛擬服務器租用 |
1個虛擬CPU 1G內存, 30G硬盤空間(SAS硬盤) |
250元/月 |
CPU(個): 內存(G): 硬盤(G): |
1個虛擬CPU 1G內存, 30G硬盤空間(SSD硬盤) |
500元/月 |
CPU(個): 內存(G): 硬盤(G): |
|
備注 |
-每增加1個CPU費用為100元/月 -每增加1G內存費用為40元/月 -每增加10G磁盤(SAS硬盤)空間費用為20元/月,每增加10G磁盤(SSD硬盤)空間費用為40元/月 *最小租用單位為月 *默認共享100M帶寬,申請獨立帶寬需額外收費 |
校內用戶:
計費類別 |
計費方式 |
節點類型 |
使用費用 |
節點共享 |
作業與其他用戶的作業一起排隊,所需資源具備時開始運行。不限使用時長,最小單位為月 |
CPU節點 |
800元/月*節點 |
GPU節點 |
2000元/月*節點 |
||
節點獨享(GPU不允許獨享) |
用戶對租用的節點獨占使用,無需排隊。不限使用時長,最小單位為月。平臺提供給獨占使用的節點數不高于總計算資源的20% |
CPU節點 |
1800元/月*節點 |
儲存資源 |
用戶在計算節點中須使用單獨的用戶HOME目錄,目錄大小進行限制。最小單位為月 |
存儲節點 |
120元 / 月*1TB |
備注 |
最小租用單位為月;多個項目共享節點資源的情況下,優先安排北京大學健康醫療大數據國家研究院牽頭和參與的項目任務,同等條件下優先安排國家部委委托任務。默認共享100M帶寬,申請獨立帶寬需額外收費 |
校外用戶:
計費類別 |
計費方式 |
節點類型 |
使用費用 |
節點共享 |
作業與其他用戶的作業一起排隊,所需資源具備時開始運行。不限使用時長,最小單位為月 |
CPU節點 |
1600元/月*節點 |
GPU節點 |
4000元/月*節點 |
||
節點獨享(GPU不允許獨享) |
用戶對租用的節點獨占使用,無需排隊。不限使用時長,最小單位為月。平臺提供給獨占使用的節點數不高于總計算資源的20% |
CPU節點 |
3600元/月*節點 |
儲存資源 |
用戶在計算節點中須使用單獨的用戶HOME目錄,目錄大小進行限制。最小單位為月 |
存儲節點 |
240元 / 月*1TB |
備注 |
最小租用單位為月;多個項目共享節點資源的情況下,優先安排北京大學健康醫療大數據國家研究院牽頭和參與的項目任務,同等條件下優先安排國家部委委托任務。默認共享100M帶寬,獨立帶寬需額外收費 |
序號 |
服務內容 |
服務費標準 |
|
1 |
運行維護 |
操作系統升級,故障處理 |
1000元/次 |
系統運行狀態監控、預警 |
100元/臺/月 |
||
應用系統運行狀態監控、預警 |
100元/個/月 |
||
2 |
訪問控制 |
限制服務器中應用的被訪問范圍,提高安全性 |
免費 |
3 |
漏洞掃描 |
強制定期(每月)對系統進行漏洞掃描,發現安全隱患及時通知并做相應處理,處理按次收費 |
1000元/次 |
4 |
網絡入侵、病毒、網絡攻擊監測、阻斷 |
應用多種檢測機制在出站的網絡流量中發現訪問遠控服務器,檢測機制包括應用遠控類型的情報指標(IOC,Indicator of Compromise)、木馬協議分析特征分析、基于深度學習算法的DGA檢測方法等。并通過可視化的方式將發現的失陷告警、關聯主機、威脅類型等進行關聯展示,呈現所有失陷情況及關聯威脅 |
100元/月 |
5 |
安全防控 |
提供出口應用層安全防護能力 |
免費 |
6 |
公網IP映射 |
根據需求提供公網IP使用映射服務(由于IP地址有限,每個業務申請不得超過1個公網IP) |
每個公網IP使用費用 2000元/年 |
7 |
VPN賬號 |
利用VPN賬號可遠程登錄服務器后臺 |
每個VPN授權費用1000元/年 |
8 |
日志分析審計 |
對日志進行收集分析、對數據庫日志審計、對異常行為進行審計,需額外收費,按次按庫收費 |
1000/個/次 |
注:用戶須遵循《北京大學健康醫療大數據國家研究院計算中心資源使用管理制度》中規定的單個項目占用存儲和計算資源不超過計算中心資源總量的20%。
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